Selected Cell
Cell:
Value:
Introduction
PCR efficiency
CP input + randomisation test
CP variation (several HKG)
Regulation plot
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81
82
83
84
85
86
87
| Relative Expression Software Tool - Multiple Condition Solver REST-MCS © - version 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Calculation Software for the Relative Expression in real-time PCR | ||||||||||||||||||||||||||||||
| using Pair Wise Fixed Reallocation Randomisation Test © | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Publications | Nucleic Acids Research 2001 Vol.29 (9) e45 | Nucleic Acids Research 2002 Vol.29 (9) e36 | ||||||||||||||||||||||||||||
| Direct download (mirror) | Nucleic Acids Research 2001 Vol.29 (9) e45 | Nucleic Acids Research 2002 Vol.29 (9) e36 | ||||||||||||||||||||||||||||
| Direct support | http://rest.gene-quantification.info/ | rest@gene-quantification.info | ||||||||||||||||||||||||||||
| © 2001 - 2004 M.W. Pfaffl & G.W. Horgan | © 2005 - 2006 M.W. Pfaffl & G.W. Horgan & Y.Vainshtein & P.Avery | |||||||||||||||||||||||||||||
| name of the gene | ||||||||||||||||||||||||||||||
| reference gene | TUB | = cells for data and name input | ||||||||||||||||||||||||||||
| [ reference gene] | L18 | * | ||||||||||||||||||||||||||||
| [target gene 2] | AtrD11 | = data output | ||||||||||||||||||||||||||||
| [target gene 3] | HarFar | |||||||||||||||||||||||||||||
| [target gene 4] | = CP variations | |||||||||||||||||||||||||||||
| [target gene 5] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| [target gene 6] | = run randomisation test | |||||||||||||||||||||||||||||
| [target gene 7] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| [target gene 8] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| [target gene 9] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| pre-selected reference gene = red | ||||||||||||||||||||||||||||||
| target gene(s) = blue | ||||||||||||||||||||||||||||||
| general header and settings = dark red | ||||||||||||||||||||||||||||||
| * Mark gene to use it for calucation of Normalization factor. Repeat randomization test to update expression ratio values if necessary. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| name of the condition | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Reference Condition | WT | |||||||||||||||||||||||||||||
| Condition I | C12#1.2 | |||||||||||||||||||||||||||||
| Condition II | C123#1.1 | |||||||||||||||||||||||||||||
| Condition III | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Condition IV | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Condition V | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Condition VI | ||||||||||||||||||||||||||||||
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186
| 0.0078125 | 32.31 | 32.81 | 33.2 | 3 | 32.773 | 0.2560390625 | 0.2560390625 | -2.1072099696478683 | -2.1072099696478683 | 0.0078125 | -69.0595923352696 | SE | ±1.307 | SE | ±0.1746 | 0.1746 | 1 | |||||
| Statistic | 0 | X | Y | X*Y | log X | Y | logX*Y | |||||||||||||||
| N | 0 | 0 | 0 | N | 0 | 0 | 0 | |||||||||||||||
| cDNA input | CP run 1 | CP run 2 | CP run 3 | n | mean CP | sum | 0 | 0 | 0 | sum | 0 | 0 | 0 | |||||||||
| [ ng ] | [target gene 4] | mean | mean | |||||||||||||||||||
| sums of X^2 and Y^2 | sums | |||||||||||||||||||||
| SS[X], SS[Y], SC[XY] | SS[X] | |||||||||||||||||||||
| 1 | 0 | 0 | variance | n-1 | variance | n-1 | ||||||||||||||||
| 0.5 | 0 | -0.3010299956639812 | std. dev. | n-1 | std. dev. | n-1 | ||||||||||||||||
| 0.25 | 0 | -0.6020599913279624 | ||||||||||||||||||||
| 0.125 | 0 | -0.9030899869919435 | linear Reg. | r | log10 Reg. | r | SE(E) | |||||||||||||||
| 0.0625 | 0 | -1.2041199826559248 | r^2 | r^2 | ||||||||||||||||||
| 0.03125 | 0 | -1.505149978319906 | intercept | intercept | Efficiency | |||||||||||||||||
| 0.015625 | 0 | -1.806179973983887 | slope | slope | 0 | |||||||||||||||||
| 0.0078125 | 0 | -2.1072099696478683 | SE | SE | 0 | |||||||||||||||||
| Statistic | 0 | X | Y | X*Y | log X | Y | logX*Y | |||||||||||||||
| N | 0 | 0 | 0 | N | 0 | 0 | 0 | |||||||||||||||
| cDNA input | CP run 1 | CP run 2 | CP run 3 | n | mean CP | sum | 0 | 0 | 0 | sum | 0 | 0 | 0 | |||||||||
| [ ng ] | [target gene 5] | mean | mean | |||||||||||||||||||
| sums of X^2 and Y^3 | sums | |||||||||||||||||||||
| SS[X], SS[Y], SC[XY] | SS[X] | |||||||||||||||||||||
| 1 | 0 | 0 | variance | n-1 | variance | n-1 | ||||||||||||||||
| 0.5 | 0 | -0.3010299956639812 | std. dev. | n-1 | std. dev. | n-1 | ||||||||||||||||
| 0.25 | 0 | -0.6020599913279624 | ||||||||||||||||||||
| 0.125 | 0 | -0.9030899869919435 | linear Reg. | r | log10 Reg. | r | SE(E) | |||||||||||||||
| 0.0625 | 0 | -1.2041199826559248 | r^3 | r^2 | ||||||||||||||||||
| 0.03125 | 0 | -1.505149978319906 | intercept | intercept | Efficiency | |||||||||||||||||
| 0.015625 | 0 | -1.806179973983887 | slope | slope | 0 | |||||||||||||||||
| 0.0078125 | 0 | -2.1072099696478683 | SE | SE | 0 | |||||||||||||||||
| Statistic | 0 | X | Y | X*Y | log X | Y | logX*Y | |||||||||||||||
| N | 0 | 0 | 0 | N | 0 | 0 | 0 | |||||||||||||||
| cDNA input | CP run 1 | CP run 2 | CP run 3 | n | mean CP | sum | 0 | 0 | 0 | sum | 0 | 0 | 0 | |||||||||
| [ ng ] | [target gene 6] | mean | mean | |||||||||||||||||||
| sums of X^2 and Y^4 | sums | |||||||||||||||||||||
| SS[X], SS[Y], SC[XY] | SS[X] | |||||||||||||||||||||
| 1 | 0 | 0 | variance | n-1 | variance | n-1 | ||||||||||||||||
| 0.5 | 0 | -0.3010299956639812 | std. dev. | n-1 | std. dev. | n-1 | ||||||||||||||||
| 0.25 | 0 | -0.6020599913279624 | ||||||||||||||||||||
| 0.125 | 0 | -0.9030899869919435 | linear Reg. | r | log10 Reg. | r | SE(E) | |||||||||||||||
| 0.0625 | 0 | -1.2041199826559248 | r^4 | r^2 | ||||||||||||||||||
| 0.03125 | 0 | -1.505149978319906 | intercept | intercept | Efficiency | |||||||||||||||||
| 0.015625 | 0 | -1.806179973983887 | slope | slope | 0 | |||||||||||||||||
| 0.0078125 | 0 | -2.1072099696478683 | SE | SE | 0 | |||||||||||||||||
| Statistic | 0 | X | Y | X*Y | log X | Y | logX*Y | |||||||||||||||
| N | 0 | 0 | 0 | N | 0 | 0 | 0 | |||||||||||||||
| cDNA input | CP run 1 | CP run 2 | CP run 3 | n | mean CP | sum | 0 | 0 | 0 | sum | 0 | 0 | 0 | |||||||||
| [ ng ] | [target gene 7] | mean | mean | |||||||||||||||||||
| sums of X^2 and Y^5 | sums | |||||||||||||||||||||
| SS[X], SS[Y], SC[XY] | SS[X] | |||||||||||||||||||||
| 1 | 0 | 0 | variance | n-1 | variance | n-1 | ||||||||||||||||
| 0.5 | 0 | -0.3010299956639812 | std. dev. | n-1 | std. dev. | n-1 | ||||||||||||||||
| 0.25 | 0 | -0.6020599913279624 | ||||||||||||||||||||
| 0.125 | 0 | -0.9030899869919435 | linear Reg. | r | log10 Reg. | r | SE(E) | |||||||||||||||
| 0.0625 | 0 | -1.2041199826559248 | r^5 | r^2 | ||||||||||||||||||
| 0.03125 | 0 | -1.505149978319906 | intercept | intercept | Efficiency | |||||||||||||||||
| 0.015625 | 0 | -1.806179973983887 | slope | slope | 0 | |||||||||||||||||
| 0.0078125 | 0 | -2.1072099696478683 | SE | SE | 0 | |||||||||||||||||
| Statistic | 0 | X | Y | X*Y | log X | Y | logX*Y | |||||||||||||||
| N | 0 | 0 | 0 | N | 0 | 0 | 0 | |||||||||||||||
| cDNA input | CP run 1 | CP run 2 | CP run 3 | n | mean CP | sum | 0 | 0 | 0 | sum | 0 | 0 | 0 | |||||||||
| [ ng ] | [target gene 8] | mean | mean | |||||||||||||||||||
| sums of X^2 and Y^6 | sums | |||||||||||||||||||||
| SS[X], SS[Y], SC[XY] | SS[X] | |||||||||||||||||||||
| 1 | 0 | 0 | variance | n-1 | variance | n-1 | ||||||||||||||||
| 0.5 | 0 | -0.3010299956639812 | std. dev. | n-1 | std. dev. | n-1 | ||||||||||||||||
| 0.25 | 0 | -0.6020599913279624 | ||||||||||||||||||||
| 0.125 | 0 | -0.9030899869919435 | linear Reg. | r | log10 Reg. | r | SE(E) | |||||||||||||||
| 0.0625 | 0 | -1.2041199826559248 | r^6 | r^2 | ||||||||||||||||||
| 0.03125 | 0 | -1.505149978319906 | intercept | intercept | Efficiency | |||||||||||||||||
| 0.015625 | 0 | -1.806179973983887 | slope | slope | 0 | |||||||||||||||||
| 0.0078125 | 0 | -2.1072099696478683 | SE | SE | 0 | |||||||||||||||||
| Statistic | 0 | X | Y | X*Y | log X | Y | logX*Y | |||||||||||||||
| N | 0 | 0 | 0 | N | 0 | 0 | 0 | |||||||||||||||
| cDNA input | CP run 1 | CP run 2 | CP run 3 | n | mean CP | sum | 0 | 0 | 0 | sum | 0 | 0 | 0 | |||||||||
| [ ng ] | [target gene 9] | mean | mean | |||||||||||||||||||
| sums of X^2 and Y^7 | sums | |||||||||||||||||||||
| SS[X], SS[Y], SC[XY] | SS[X] | |||||||||||||||||||||
| 1 | 0 | 0 | variance | n-1 | variance | n-1 | ||||||||||||||||
| 0.5 | 0 | -0.3010299956639812 | std. dev. | n-1 | std. dev. | n-1 | ||||||||||||||||
| 0.25 | 0 | -0.6020599913279624 | ||||||||||||||||||||
| 0.125 | 0 | -0.9030899869919435 | linear Reg. | r | log10 Reg. | r | SE(E) | |||||||||||||||
| 0.0625 | 0 | -1.2041199826559248 | r^7 | r^2 | ||||||||||||||||||
| 0.03125 | 0 | -1.505149978319906 | intercept | intercept | Efficiency | |||||||||||||||||
| 0.015625 | 0 | -1.806179973983887 | slope | slope | 0 | |||||||||||||||||
| 0.0078125 | 0 | -2.1072099696478683 | SE | SE | 0 | |||||||||||||||||
| Statistic | 0 | X | Y | X*Y | log X | Y | logX*Y |
A
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40
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46
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48
49
50
51
52
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54
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57
58
59
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81
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88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
| Pair Wise Fixed Reallocation Randomisation Test © | ||||||||||||||||||||
| Publications | Nucleic Acids Research 2001 Vol.29 (9) e45 | Nucleic Acids Research 2002 Vol.29 (9) e36 | ||||||||||||||||||
| Direct download (mirror) | Nucleic Acids Research 2001 Vol.29 (9) e45 | Nucleic Acids Research 2002 Vol.29 (9) e36 | ||||||||||||||||||
| Direct support | http://rest.gene-quantification.info/ | rest@gene-quantification.info | ||||||||||||||||||
| © 2001 & 2004 M.W. Pfaffl & G.W. Horgan | ||||||||||||||||||||
| © 2005 M.W. Pfaffl & G.W. Horgan & Y.Vainshtein & P.Avery | ||||||||||||||||||||
| * Mark gene to use it for calucation of Normalization factor. Repeat randomization test to update expression ratio values if necessary. | Condition I | 2 | ||||||||||||||||||
| alternative Efficiency | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | Condition II | |||||||||
| Efficiency | 2.05 | 1.95 | 2.2 | 2.26 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | Condition III | |||||||||
| Condition IV | ||||||||||||||||||||
| CP input | [ reference gene ] | [ reference gene] | [target gene 2] | [target gene 3] | [target gene 4] | [target gene 5] | [target gene 6] | [target gene 7] | [target gene 8] | [target gene 9] | Condition V | |||||||||
| Ref. Condition | * | Condition VI | ||||||||||||||||||
| WT | TUB | L18 | AtrD11 | HarFar | ||||||||||||||||
| control 1 | 8.81 | 19.82 | 35 | 35 | ||||||||||||||||
| control 2 | 8.51 | 20.08 | 35 | 32.72 | ||||||||||||||||
| control 3 | 9.8 | 20.17 | 32.81 | 33.39 | ||||||||||||||||
| control 4 | 9.28 | 21.71 | 35 | 35 | ||||||||||||||||
| control 5 | 8.82 | 21.17 | 35 | 35 | ||||||||||||||||
| control 6 | 9.47 | 21.4 | 35 | 35 | ||||||||||||||||
| control 7 | ||||||||||||||||||||
| control 8 | ||||||||||||||||||||
| control 9 | ||||||||||||||||||||
| control 10 | ||||||||||||||||||||
| CP input | [ reference gene ] | [ reference gene] | [target gene 2] | [target gene 3] | [target gene 4] | [target gene 5] | [target gene 6] | [target gene 7] | [target gene 8] | [target gene 9] | ||||||||||
| Condition I | TUB | L18 | AtrD11 | HarFar | ||||||||||||||||
| C12#1.2 | ||||||||||||||||||||
| sample 1 | 7.62 | 19.47 | 26.68 | 26.94 | ||||||||||||||||
| sample 2 | 7.88 | 20.03 | 26.89 | 27.45 | ||||||||||||||||
| sample 3 | 9.23 | 20.15 | 26.62 | 27.76 | ||||||||||||||||
| sample 4 | 7.47 | 20.12 | 27.08 | 27.1 | ||||||||||||||||
| sample 5 | 7.41 | 20.14 | 27.09 | 27.29 | ||||||||||||||||
| sample 6 | 7.89 | 20.61 | 27.07 | 27.58 | ||||||||||||||||
| sample 7 | ||||||||||||||||||||
| sample 8 | ||||||||||||||||||||
| sample 9 | ||||||||||||||||||||
| sample 10 | ||||||||||||||||||||
| Specify the range on the spreadsheet. Go to last cell of last target gene to define the spreadsheet. | ||||||||||||||||||||
| Significant | UP | UP | ||||||||||||||||||
| Genes | Ref. | Ref. | 2 | 3 | ||||||||||||||||
| PCR Efficiencies | 2.05 | 1.95 | 2.2 | 2.26 | ||||||||||||||||
| Control Means | 9.115 | 20.724999999999998 | 34.635 | 34.35166666666667 | ||||||||||||||||
| Sample Means | 7.916666666666667 | 20.086666666666666 | 26.904999999999998 | 27.353333333333335 | ||||||||||||||||
| Expression Ratios | 233.1124242730943 | 158.05454592517887 | ||||||||||||||||||
| p-Values | 0.0015 | 0.0015 | ||||||||||||||||||
| Expression Ratios-nn | 2.363660205525015 | 1.5315767334467987 | 443.53441421479744 | 300.72455665762305 | ||||||||||||||||
| p-Values-nn | 0.007 | 0.1205 | 0.001 | 0.001 | ||||||||||||||||
| 2000 | of | 2000 | done | |||||||||||||||||
| CP input | [ reference gene ] | [ reference gene] | [target gene 2] | [target gene 3] | [target gene 4] | [target gene 5] | [target gene 6] | [target gene 7] | [target gene 8] | [target gene 9] | ||||||||||
| Condition II | TUB | L18 | AtrD11 | HarFar | ||||||||||||||||
| C123#1.1 | ||||||||||||||||||||
| sample 1 | 8.18 | 18.86 | 26.92 | 27.51 | ||||||||||||||||
| sample 2 | 7.81 | 18.64 | 26.8 | 27.29 | ||||||||||||||||
| sample 3 | 8.7 | 18.93 | 26.85 | 27.65 | ||||||||||||||||
| sample 4 | 8.5 | 19.46 | 27.83 | 27.25 | ||||||||||||||||
| sample 5 | 9.27 | 19.56 | 27.82 | 27.59 | ||||||||||||||||
| sample 6 | 9.51 | 19.85 | 27.44 | 27.91 | ||||||||||||||||
| sample 7 | ||||||||||||||||||||
| sample 8 | ||||||||||||||||||||
| sample 9 | ||||||||||||||||||||
| sample 10 | ||||||||||||||||||||
| Specify the range on the spreadsheet. Go to last cell of last target gene to define the spreadsheet. | ||||||||||||||||||||
| Significant | UP | UP | ||||||||||||||||||
| Genes | Ref. | Ref. | 2 | 3 | ||||||||||||||||
| PCR Efficiencies | 2.05 | 1.95 | 2.2 | 2.26 | ||||||||||||||||
| Control Means | 9.115 | 20.724999999999998 | 34.635 | 34.35166666666667 | ||||||||||||||||
| Sample Means | 8.661666666666665 | 19.21666666666667 | 27.276666666666667 | 27.53333333333333 | ||||||||||||||||
| Expression Ratios | 169.9266837129523 | 133.36157924095383 | ||||||||||||||||||
| p-Values | 0.0045 | 0.004 | ||||||||||||||||||
| Expression Ratios-nn | 1.3846130387930105 | 2.7382233663032918 | 330.87215982524737 | 259.67454196716534 | ||||||||||||||||
| p-Values-nn | 0.2065 | 0.003 | 0.001 | 0.001 | ||||||||||||||||
| 2000 | of | 2000 | done | |||||||||||||||||
| CP input | [ reference gene ] | [ reference gene] | [target gene 2] | [target gene 3] | [target gene 4] | [target gene 5] | [target gene 6] | [target gene 7] | [target gene 8] | [target gene 9] | ||||||||||
| Condition III | TUB | L18 | AtrD11 | HarFar | ||||||||||||||||
| sample 1 | ||||||||||||||||||||
| sample 2 | ||||||||||||||||||||
| sample 3 | ||||||||||||||||||||
| sample 4 | ||||||||||||||||||||
| sample 5 | ||||||||||||||||||||
| sample 6 |
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97
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99
100
| Variation data output - calculation based on group means | |||||||||||||||||
| Publications | Nucleic Acids Research 2001 Vol.29 (9) e45 | Nucleic Acids Research 2002 Vol.29 (9) e36 | |||||||||||||||
| Direct download (mirror) | Nucleic Acids Research 2001 Vol.29 (9) e45 | Nucleic Acids Research 2002 Vol.29 (9) e36 | |||||||||||||||
| Direct support | http://rest.gene-quantification.info/ | rest@gene-quantification.info | |||||||||||||||
| © 2001 - 2004 M.W. Pfaffl & G.W. Horgan | |||||||||||||||||
| © 2005 - 2006 M.W. Pfaffl & G.W. Horgan & Y.Vainshtein & P.Avery | |||||||||||||||||
| Efficiency | 2.05 | 1.95 | 2.2 | 2.26 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||
| Standard Error | ±0.05277 | ±0 | ±0 | ±0 | ±0 | ±0 | ±0 | ±0 | ±0 | ±0 | |||||||
| Standard Error | 0.05276926620663719 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | |||||||
| control | [ reference gene ] | [ reference gene] | [target gene 2] | [target gene 3] | [target gene 4] | [target gene 5] | [target gene 6] | [target gene 7] | [target gene 8] | [target gene 9] | |||||||
| WT | TUB | L18 | AtrD11 | HarFar | |||||||||||||
| * | |||||||||||||||||
| n | 6 | 6 | 6 | 6 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | |||||||
| mean | 9.115 | 20.725 | 34.635 | 34.352 | |||||||||||||
| standard error | 0.197 | 0.325 | 0.365 | 0.419 | |||||||||||||
| CV [ % ] | 2.161272627537027 | 1.5681544028950543 | 1.053847264327992 | 1.2197251979506287 | |||||||||||||
| sample(s) | [ reference gene ] | [ reference gene] | [target gene 2] | [target gene 3] | [target gene 4] | [target gene 5] | [target gene 6] | [target gene 7] | [target gene 8] | [target gene 9] | |||||||
| Condition I | TUB | L18 | AtrD11 | HarFar | |||||||||||||
| C12#1.2 | |||||||||||||||||
| n | 6 | 6 | 6 | 6 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | |||||||
| mean | 7.917 | 20.087 | 26.905 | 27.353 | |||||||||||||
| standard error | 0.275 | 0.149 | 0.086 | 0.125 | |||||||||||||
| CV [ % ] | 3.4735379562965774 | 0.7417732862050083 | 0.31964318899832744 | 0.45698826454136654 | |||||||||||||
| E(target)^CP | 2.3630946967341626 | 1.5312358274164033 | 443.5344142147964 | 300.88806790869586 | |||||||||||||
| 1.242280081131318 | 0.8049714514373614 | 233.16626660656976 | 158.1770099732527 | ||||||||||||||
| sample(s) | [ reference gene ] | [ reference gene] | [target gene 2] | [target gene 3] | [target gene 4] | [target gene 5] | [target gene 6] | [target gene 7] | [target gene 8] | [target gene 9] | |||||||
| Condition II | TUB | L18 | AtrD11 | HarFar | |||||||||||||
| C123#1.1 | |||||||||||||||||
| n | 6 | 6 | 6 | 6 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | |||||||
| mean | 8.662 | 19.217 | 27.277 | 27.533 | |||||||||||||
| standard error | 0.263 | 0.193 | 0.197 | 0.1 | |||||||||||||
| CV [ % ] | 3.0362502886169476 | 1.0043190924702088 | 0.722220185504271 | 0.3632005230087531 | |||||||||||||
| E(target)^CP | 1.384281768315324 | 2.7376138788138658 | 330.78521172164193 | 259.8157333274602 | |||||||||||||
| 0.7110925891813757 | 1.406286628793615 | 169.92126751211512 | 133.46491064946025 | ||||||||||||||
| sample(s) | [ reference gene ] | [ reference gene] | [target gene 2] | [target gene 3] | [target gene 4] | [target gene 5] | [target gene 6] | [target gene 7] | [target gene 8] | [target gene 9] | |||||||
| Condition III | TUB | L18 | AtrD11 | HarFar | |||||||||||||
| n | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | |||||||
| mean | |||||||||||||||||
| standard error | |||||||||||||||||
| CV [ % ] | |||||||||||||||||
| E(target)^CP | |||||||||||||||||
| sample(s) | [ reference gene ] | [ reference gene] | [target gene 2] | [target gene 3] | [target gene 4] | [target gene 5] | [target gene 6] | [target gene 7] | [target gene 8] | [target gene 9] | |||||||
| Condition IV | TUB | L18 | AtrD11 | HarFar | |||||||||||||
| n | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | |||||||
| mean | |||||||||||||||||
| standard error | |||||||||||||||||
| CV [ % ] | |||||||||||||||||
| E(target)^CP | |||||||||||||||||
| sample(s) | [ reference gene ] | [ reference gene] | [target gene 2] | [target gene 3] | [target gene 4] | [target gene 5] | [target gene 6] | [target gene 7] | [target gene 8] | [target gene 9] | |||||||
| Condition V | TUB | L18 | AtrD11 | HarFar | |||||||||||||
| n | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | |||||||
| mean | |||||||||||||||||
| standard error | |||||||||||||||||
| CV [ % ] | |||||||||||||||||
| E(target)^CP | |||||||||||||||||
| sample(s) | [ reference gene ] | [ reference gene] | [target gene 2] | [target gene 3] | [target gene 4] | [target gene 5] | [target gene 6] | [target gene 7] | [target gene 8] | [target gene 9] | |||||||
| Condition VI | TUB | L18 | AtrD11 | HarFar | |||||||||||||
| n | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | |||||||
| mean | |||||||||||||||||
| standard error | |||||||||||||||||
| CV [ % ] | |||||||||||||||||
| E(target)^CP | |||||||||||||||||
| true | true | false | false | false | false | false | false | false | false | ||||||||
| Condition 1 | 2.3630946967341626 | 1.5312358274164033 | |||||||||||||||
| Condition 2 | 1.384281768315324 | 2.7376138788138658 | |||||||||||||||
| Condition 3 | |||||||||||||||||
| Condition 4 | |||||||||||||||||
| Condition 5 | |||||||||||||||||
| Condition 6 | |||||||||||||||||
| Condition I | Condition II | Condition III | Condition IV | Condition V | Condition VI | ||||||||||||
| C12#1.2 | C123#1.1 | ||||||||||||||||
| Normalization Factor ** | 1.9022237679140301 | 1.946696941264621 | |||||||||||||||
| [ reference gene ] | [ reference gene] | [target gene 2] | [target gene 3] | [target gene 4] | [target gene 5] | [target gene 6] | [target gene 7] | [target gene 8] | [target gene 9] | ||||||||
| Condition I | TUB | L18 | AtrD11 | HarFar | |||||||||||||
| C12#1.2 | Exression ratio(s): | *** | UP | UP | |||||||||||||
| Target gene is UP-regulated by the factor: | 233.16626660656976 | 158.1770099732527 | |||||||||||||||
| Target gene is DOWN-regulated by the factor: | |||||||||||||||||
| Absolute gene regulation: | 233.16626660656976 | 158.1770099732527 | |||||||||||||||
| Standard Error: | ±89.49979 | ±68.40536 | |||||||||||||||
| 233.16626660656976 | 158.1770099732527 | ||||||||||||||||
| 2 log (directional): | 7.865215271110303 | 7.305396118233902 | |||||||||||||||
| 2 log (standard error): | ±3.01903 | ±3.1593 | |||||||||||||||
| 89.49979 | 68.40536 |
A
B
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35
| Graphical data output | Log Ratio | Condition I | Condition II | Condition III | Condition IV | Condition V | Condition VI | |||||||||||||||||||||||||
| C12#1.2 | C123#1.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||
| Publications | Nucleic Acids Research 2001 Vol.29 (9) e45 | Nucleic Acids Research 2002 Vol.29 (9) e36 | L18 | |||||||||||||||||||||||||||||
| Direct download (mirror) | Nucleic Acids Research 2001 Vol.29 (9) e45 | Nucleic Acids Research 2002 Vol.29 (9) e36 | AtrD11 | 7.865215271110303 | 7.408722622720946 | |||||||||||||||||||||||||||
| Direct support | http://rest.gene-quantification.info/ | rest@gene-quantification.info | HarFar | 7.305396118233902 | 7.060316681604237 | |||||||||||||||||||||||||||
| © 2001 - 2004 M.W. Pfaffl & G.W. Horgan | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| © 2005 - 2006 M.W. Pfaffl & G.W. Horgan & Y.Vainshtein & P.Avery | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| St.Dev | Condition I | Condition II | Condition III | Condition IV | Condition V | Condition VI | ||||||||||||||||||||||||||
| C12#1.2 | C123#1.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||
| L18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| AtrD11 | 3.01902640254965 | 2.98860853842695 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| HarFar | 3.15929762166383 | 2.9882825569273 | ||||||||||||||||||||||||||||||
