Selected Cell
Cell:
Value:
overview alphabetic
functional classes
L. plantarum strain comparison
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| S. pyogenes | E. faecalis | L. plantarum | L. lactis | ||||||
| CDM complete | full medium | ||||||||
| CDM 1 | ala | ||||||||
| CDM 2 | arg | ||||||||
| CDM 3 | asn | ||||||||
| CDM 4 | asp | ||||||||
| CDM 5 | cys | ||||||||
| CDM 6 | cyn | ||||||||
| CDM 7 | glu | ||||||||
| CDM 8 | gln | ||||||||
| CDM 9 | gly | ||||||||
| CDM 10 | his | ||||||||
| CDM 11 | ile | ||||||||
| CDM 12 | leu | ||||||||
| CDM 13 | lys | ||||||||
| CDM 14 | met | ||||||||
| CDM 15 | phe | ||||||||
| CDM 16 | pro | ||||||||
| CDM 17 | ser | growth in absence, e.g. non essential | |||||||
| CDM 18 | thr | no growth in absence, e.g. essential | |||||||
| CDM 19 | try | not determined | |||||||
| CDM 20 | tyr | ||||||||
| CDM 21 | val | ||||||||
| CDM 22 | cys/cyn | ||||||||
| CDM 23 | glu/gln | ||||||||
| CDM 24 | gly/ser | ||||||||
| CDM 25 | asn/asp | ||||||||
| CDM 26 | cys/cyn/ser | ||||||||
| CDM 27 | no amino acids | ||||||||
| S. pyogenes | E. faecalis | L. plantarum | L. lactis | ||||||
| ARG | ARG | ARG | HIS | ||||||
| HIS | HIS | ILE | ILE | ||||||
| ILE | ILE | LEU | LEU | ||||||
| LEU | LEU | MET | MET | ||||||
| LYS | MET | PHE | VAL | ||||||
| MET | TRY | TRY | GLU/GLN | ||||||
| PHE | VAL | VAL | |||||||
| THR | GLU/GLN | GLN/GLU | |||||||
| TRP | |||||||||
| TYR | L. lactis agrees with literature: P. Ruhdal Jensen, K. Hammer AEM 1993 | ||||||||
| VAL | L. plantarum: severely reduced, but sustainable growth in absence of tyrosine | ||||||||
| CYS/CYN | L. plantarum agrees with literature: Teusink et al. AEM 2005 | ||||||||
| GLU/GLN | |||||||||
| CYS/CYN/SER |
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| Aliphatic | S. pyogenes | E. faecalis | L. plantarum | L. lactis | |||||||||||
| GLY | |||||||||||||||
| ALA | |||||||||||||||
| branched chain | VAL | ||||||||||||||
| LEU | |||||||||||||||
| ILE | |||||||||||||||
| Hydroxyl/Sulfur | S. pyogenes | E. faecalis | L. plantarum | L. lactis | |||||||||||
| SER | |||||||||||||||
| CYS | |||||||||||||||
| CYN | |||||||||||||||
| THR | |||||||||||||||
| MET | growth in absence, e.g. non essential | ||||||||||||||
| CYS/CYN | no growth in absence, e.g. essential | ||||||||||||||
| CYS/CYN/SER | not determined | ||||||||||||||
| Cyclic | S. pyogenes | E. faecalis | L. plantarum | L. lactis | L. lactis agrees with literature: P. Ruhdal Jensen, K. Hammer AEM 1993 | ||||||||||
| PRO | L. plantarum: severely reduced, but sustainable growth in absence of tyrosine | ||||||||||||||
| L. plantarum agrees with literature: Teusink et al. AEM 2005 | |||||||||||||||
| Aromatic | S. pyogenes | E. faecalis | L. plantarum | L. lactis | |||||||||||
| PHE | |||||||||||||||
| TYR | |||||||||||||||
| TRY | |||||||||||||||
| Basic | S. pyogenes | E. faecalis | L. plantarum | L. lactis | |||||||||||
| HIS | |||||||||||||||
| LYS | |||||||||||||||
| ARG | |||||||||||||||
| Acidic | S. pyogenes | E. faecalis | L. plantarum | L. lactis | |||||||||||
| ASN | |||||||||||||||
| GLU | |||||||||||||||
| GLN | |||||||||||||||
| ASP | |||||||||||||||
| ASN/ASP | |||||||||||||||
| GLU/GLN |
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| All four L. plantarum strains compared (ATCC, NC8, JDM1, WCFS1) do have the same amino acid auxotrophies | |||||||||
