Selected Cell
Cell:
Value:
Sheet1
Sheet2
Sheet3
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
| Anaerob | |||||||||||||||||||
| Gene | V583 | V583 | V583 | SNITT | rex | rex | rex | SNITT | V583 | V583 | V583 | SNITT | rex | rex | rex | SNITT | Efficiency | ||
| ldh1 | 14.51 | 15.1 | 14.52 | 14.709999999999999 | 14.46 | 14.33 | 14.41 | 14.4 | 16.47 | 16.61 | 16.58 | 16.55333333333333 | 14.41 | 14.57 | 14.49 | 14.49 | 1.88 | ||
| ldh2 | 21.08 | 21.19 | 22.08 | 21.45 | 20.14 | 19.13 | 19.74 | 19.669999999999998 | 23.55 | 22.76 | 23.02 | 23.11 | 18.91 | 18.88 | 19.08 | 18.956666666666667 | 2.02 | ||
| arcC | 20.01 | 20.83 | 20.61 | 20.483333333333334 | 21.94 | 21.81 | 20.93 | 21.560000000000002 | 18.67 | 20.25 | 18.06 | 18.993333333333336 | 20.63 | 21.25 | 19.34 | 20.406666666666666 | 2.03 | ||
| ef1356 | 17.38 | 17.15 | 16.75 | 17.093333333333334 | 16.58 | 15.41 | 15.995 | 20.07 | 21.06 | 20.564999999999998 | 17.58 | 18.51 | 17.28 | 17.790000000000003 | 2.06 | ||||
| pflA | 19.82 | 19.93 | 19.12 | 19.623333333333335 | 14.4 | 15.2 | 14.8 | 17.78 | 18.04 | 18.27 | 18.03 | 14.87 | 14.02 | 14.35 | 14.413333333333334 | 2.2 | |||
| ackA | 17.27 | 17.22 | 17.244999999999997 | 15.97 | 16.86 | 17.02 | 16.616666666666664 | 20.7 | 19.78 | 18.84 | 19.773333333333337 | 15.11 | 16.04 | 16.14 | 15.763333333333334 | 1.97 | |||
| dnaB | 20.18 | 19.24 | 19.11 | 19.51 | 21.3 | 20.35 | 20.52 | 20.723333333333333 | 22.28 | 22.26 | 22.270000000000003 | 20.42 | 19.7 | 19.51 | 19.87666666666667 | 2.02 | |||
| 23S | 9.24 | 8.71 | 8.72 | 8.89 | 9.09 | 8.95 | 8.94 | 8.993333333333332 | 9.76 | 9.98 | 10.08 | 9.94 | 8.27 | 8.97 | 8.3 | 8.513333333333334 | 1.91 | ||
| Gene | ΔCt batch 1 | ΔCt batch 2 | Batch1 | Batch2 | Ratio batch1 | Ratio batch2 | Snitt | Log | qPCR | Microarray | |||||||||
| ldh1 | 0.3099999999999987 | 2.063333333333331 | 1.2161550100879788 | 3.6785700362174456 | 1.3002565430859419 | 1.4612956507612713 | 1.3807760969236065 | 0.14012326021931518 | ldh1 | 0.4654793948697558 | 0.3356 | ||||||||
| ldh2 | 1.7800000000000011 | 4.153333333333332 | 3.49562983697526 | 18.544965131617015 | 3.7373653276359216 | 7.3669052440325675 | 5.552135285834245 | 0.7444600397910842 | ldh2 | 2.4730427217029662 | 2.119 | ||||||||
| arcC | -1.076666666666668 | -1.4133333333333304 | 0.4665833810337506 | 0.36762547592472505 | 0.49884931530266624 | 0.14603759172415764 | 0.32244345351341197 | -0.49154643600641057 | arcC | -1.6328819157114483 | -2.746 | ||||||||
| ef1356 | 1.0983333333333345 | 2.774999999999995 | 2.2117234895238767 | 7.429875500578445 | 2.364672196303538 | 2.95148512813342 | 2.658078662218479 | 0.4245678291507001 | ef1356 | 1.4103837998410484 | 0.03569 | ||||||||
| pflA (ef1612) | 4.823333333333334 | 3.616666666666667 | 44.83516067785307 | 17.315247181407177 | 47.93567476852368 | 6.878405235982569 | 27.407040002253126 | 1.437862133675074 | pflA* | 4.7764746184299165 | NA | ||||||||
| ackA (ef1983) | 0.6283333333333339 | 4.010000000000003 | 1.531168357024425 | 15.163853042945892 | 1.637054206308071 | 6.023773445190445 | 3.830413825749258 | 0.5832456963004015 | ackA* | 1.9375002647624457 | NA | ||||||||
| dnaB | -1.2133333333333312 | 2.3933333333333344 | 0.4260955563519822 | 5.380313859390275 | 0.4555616105930689 | 2.1373058457633918 | 1.2964337281782303 | 0.11275032116543836 | 0.3745484595870429 | ||||||||||
| 23S | -0.10333333333333172 | 1.4266666666666659 | 0.9353192772263524 | 2.5173345546474946 | 1 | 1 | 1 | 0 | 0 | ||||||||||
| Aerob | |||||||||||||||||||
| Gene | V583 | V583 | V583 | SNITT | rex | rex | rex | SNITT | V583 | V583 | V583 | SNITT | rex | rex | rex | SNITT | Efficiency | ||
| ldh1 | 14.38 | 14.42 | 15.05 | 14.616666666666667 | 17.15 | 16.92 | 16.29 | 16.786666666666665 | 16.13 | 16.32 | 16.08 | 16.176666666666666 | 17.43 | 17.25 | 18.29 | 17.656666666666666 | 1.88 | ||
| ldh2 | 22.01 | 23.01 | 22.07 | 22.363333333333333 | 24.09 | 24.79 | 23.99 | 24.289999999999996 | 23.46 | 23.95 | 24.84 | 24.083333333333332 | 25.02 | 24.96 | 24.95 | 24.97666666666667 | 2.02 | ||
| arcC | 18.89 | 18.78 | 18.99 | 18.886666666666667 | 19.61 | 20.2 | 19.57 | 19.793333333333333 | 19.99 | 20.08 | 20.034999999999997 | 22.31 | 23.93 | 20.22 | 22.153333333333332 | 2.03 | |||
| ef1356 | 12.62 | 13.01 | 12.96 | 12.863333333333335 | 14.48 | 12.52 | 13.68 | 13.56 | 11.9 | 11.64 | 11.77 | 10.72 | 12.7 | 14.54 | 12.653333333333334 | 2.06 | |||
| pflA | 20.02 | 19.43 | 19.89 | 19.78 | 20.96 | 20.96 | 24.13 | 24.12 | 24.54 | 24.263333333333332 | 23.92 | 23.57 | 23.745 | 2.2 | |||||
| ackA | 14.33 | 15.1 | 15.16 | 14.863333333333335 | 17.21 | 16.95 | 18.11 | 17.423333333333332 | 18.3 | 18.14 | 18.22 | 17.15 | 16.71 | 16.15 | 16.669999999999998 | 1.97 | |||
| dnaB | 14.85 | 14.68 | 15.85 | 15.126666666666667 | 19.78 | 18.9 | 19.7 | 19.459999999999997 | 18.59 | 18.58 | 18.1 | 19.459999999999997 | 18.76 | 19.62 | 18.423333333333336 | 2.02 | |||
| 23S | 5.34 | 5.42 | 6.36 | 5.706666666666667 | 9.14 | 8.95 | 8.4 | 8.83 | 8.01 | 8.07 | 7.91 | 8.83 | 7.11 | 7.14 | 7.996666666666666 | 1.91 | |||
| Gene | ΔCt batch 1 | ΔCt batch 2 | Batch1 | Batch2 | Ratio batch1 | Ratio batch2 | Snitt | Log | qPCR | Microarray | |||||||||
| ldh1 | -2.169999999999998 | -1.4800000000000004 | 0.25414259909262993 | 0.39286775314898315 | 1.917954723883893 | 0.22911414921333279 | 1.0735344365486128 | 0.03081598017717188 | ldh1 | 0.10236847032203931 | -0.18373778924070602 | ||||||||
| ldh2 | -1.9266666666666623 | -0.893333333333338 | 0.25804158144483175 | 0.5336044506970133 | 1.9473794313018722 | 0.31118952563035124 | 1.1292844784661118 | 0.05280335898901294 | ldh2 | 0.17540896173002524 | 0.7768488239890621 | ||||||||
| arcC | -0.9066666666666663 | -2.118333333333336 | 0.5262639150848414 | 0.22316233301298863 | 3.971590617040614 | 0.1301446801243165 | 2.0508676485824653 | 0.3119376343591179 | arcC | 1.0362343914302552 | -0.109528432025127 | ||||||||
| ef1356 | -0.6966666666666654 | -0.8833333333333346 | 0.6044204777604932 | 0.5281418981909578 | 4.561419906272279 | 0.30800385294551913 | 2.434711879608899 | 0.3864475747911099 | ef1356 | 1.2837510558996732 | -0.811584203588886 | ||||||||
| pflA | -1.1799999999999997 | 0.5183333333333309 | 0.3944039325913998 | 1.5048357135173447 | 2.9764741854880814 | 0.8775959631321995 | 1.9270350743101403 | 0.2848896193989528 | pflA | 0.946382830623149 | -0.0987472326984853 | ||||||||
| ackA | -2.559999999999997 | 1.5500000000000007 | 0.17626515248487074 | 2.8603728722959456 | 1.3302318583011472 | 1.6681234125633628 | 1.499177635432255 | 0.175853094834519 | ackA | 0.5841713363036803 | 0.46382627698786705 | ||||||||
| dnaB | -4.33333333333333 | 1.0366666666666617 | 0.04751281177218553 | 2.0727531619495103 | 0.358568072054128 | 1.2087962766677294 | 0.7836821743609287 | -0.10586003158441859 | -0.35165941304594367 | ||||||||||
| 23S | -3.123333333333333 | 0.8333333333333339 | 0.1325070899369233 | 1.714724972237206 | 1 | 1 | 1 | 0 | 0 | ||||||||||
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
| Anaerob | ||||||||||||||||||
| Gene | V583 | V583 | V583 | SNITT | V583 | V583 | V583 | SNITT | Snitt to paraleller | Anaerob - aerob | Normalisert anerob - aerob | |||||||
| ldh1 | 14.51 | 15.1 | 14.52 | 14.709999999999999 | 16.47 | 16.61 | 16.58 | 16.55333333333333 | 15.631666666666664 | 0.23499999999999766 | -2.328333333333335 | Høyere uttrykt anaerobt | ||||||
| ldh2 | 21.08 | 21.19 | 22.08 | 21.45 | 23.55 | 22.76 | 23.02 | 23.11 | 22.28 | -0.9433333333333316 | -3.506666666666664 | Høyere uttrykt anaerobt | ||||||
| arcC | 20.01 | 20.83 | 20.61 | 20.483333333333334 | 18.67 | 20.25 | 18.06 | 18.993333333333336 | 19.738333333333337 | 0.2775000000000034 | -2.285833333333329 | Høyere uttrykt anaerobt | ||||||
| ef1356 | 17.38 | 17.15 | 16.75 | 17.093333333333334 | 20.07 | 21.06 | 20.564999999999998 | 18.829166666666666 | 6.512499999999999 | 3.9491666666666667 | Lavere uttrykt anaerobt | |||||||
| pflA | 19.82 | 19.93 | 19.12 | 19.623333333333335 | 17.78 | 18.04 | 18.27 | 18.03 | 18.826666666666668 | -3.1950000000000003 | -5.758333333333333 | Høyere uttrykt anaerobt | ||||||
| ackA | 17.27 | 17.22 | 17.244999999999997 | 20.7 | 19.78 | 18.84 | 19.773333333333337 | 18.509166666666665 | 1.9674999999999976 | -0.595833333333335 | Høyere uttrykt anaerobt | |||||||
| dnaB | 20.18 | 19.24 | 19.11 | 19.51 | 22.28 | 22.26 | 22.270000000000003 | 20.89 | 4.114999999999998 | 1.5516666666666659 | Lavere uttrykt anaerobt | |||||||
| 23S | 9.24 | 8.71 | 8.72 | 8.89 | 9.76 | 9.98 | 10.08 | 9.94 | 9.415 | 2.5633333333333326 | 0 | |||||||
| Aerob | ||||||||||||||||||
| Gene | V583 | V583 | V583 | SNITT | V583 | V583 | V583 | SNITT | Snitt to paraleller | |||||||||
| ldh1 | 14.38 | 14.42 | 15.05 | 14.616666666666667 | 16.13 | 16.32 | 16.08 | 16.176666666666666 | 15.396666666666667 | |||||||||
| ldh2 | 22.01 | 23.01 | 22.07 | 22.363333333333333 | 23.46 | 23.95 | 24.84 | 24.083333333333332 | 23.223333333333333 | |||||||||
| arcC | 18.89 | 18.78 | 18.99 | 18.886666666666667 | 19.99 | 20.08 | 20.034999999999997 | 19.460833333333333 | ||||||||||
| ef1356 | 12.62 | 13.01 | 12.96 | 12.863333333333335 | 11.9 | 11.64 | 11.77 | 12.316666666666666 | ||||||||||
| pflA | 20.02 | 19.43 | 19.89 | 19.78 | 24.13 | 24.12 | 24.54 | 24.263333333333332 | 22.02166666666667 | |||||||||
| ackA | 14.33 | 15.1 | 15.16 | 14.863333333333335 | 18.3 | 18.14 | 18.22 | 16.541666666666668 | ||||||||||
| dnaB | 14.85 | 14.68 | 15.85 | 15.126666666666667 | 18.59 | 18.58 | 18.1 | 18.423333333333336 | 16.775000000000002 | |||||||||
| 23S | 5.34 | 5.42 | 6.36 | 5.706666666666667 | 8.01 | 8.07 | 7.91 | 7.996666666666666 | 6.851666666666667 | |||||||||
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
