$\mathrm{compartment}(\frac{\frac{\mathrm{q1}\mathrm{light}\mathrm{cP}+1}{1+(\mathrm{r1}\mathrm{cP9})^2+(\mathrm{r2}\mathrm{cP7})^2+(\mathrm{r3}\mathrm{cP5n})^2+(\mathrm{r4}\mathrm{cTn})^2}}{1+(\mathrm{r11}(\mathrm{cL}+\mathrm{f5}\mathrm{cC}))^2}-\mathrm{m1}\mathrm{cL\_m})$ $\mathrm{compartment}((\mathrm{light}+\mathrm{m4}(1-\mathrm{light}))\mathrm{cL\_m}-\mathrm{m3}\mathrm{cL})$ $\mathrm{compartment}(\frac{\mathrm{q1}\mathrm{light}\mathrm{cP}+1}{1+(\mathrm{r1}\mathrm{cP9})^2+(\mathrm{r2}\mathrm{cP7})^2+(\mathrm{r3}\mathrm{cP5n})^2+(\mathrm{r4}\mathrm{cTn})^2}-\mathrm{m1}\mathrm{cC\_m})$ $\mathrm{compartment}((\mathrm{light}+\mathrm{m4}(1-\mathrm{light}))\mathrm{cC\_m}-\mathrm{m3}\mathrm{cC})$ $\mathrm{compartment}(\mathrm{p7}(1-\mathrm{light})(1-\mathrm{cP})-\mathrm{m11}\mathrm{cP}\mathrm{light})$ $\mathrm{compartment}(\mathrm{q3}\mathrm{cP}\mathrm{light}+\frac{1+\mathrm{a3}\mathrm{r33}\mathrm{cR}}{(1+\mathrm{r33}\mathrm{cR})(1+(\mathrm{r5}(\mathrm{cL}+\mathrm{f5}\mathrm{cC}))^2)(1+\left(\frac{\mathrm{r6}(\mathrm{cLUX}+\mathrm{f6}\mathrm{cNOX})(\mathrm{cE34}+\mathrm{f1}\mathrm{cE3})}{1+\mathrm{f3}(\mathrm{cLUX}+\mathrm{f2}\mathrm{cNOX})+\mathrm{f4}(\mathrm{cE34}+\mathrm{f1}\mathrm{cE3})}\right)^2)(1+(\mathrm{r7}\mathrm{cTn})^2)(1+(\mathrm{r40}\mathrm{cP5n})^2)}-\mathrm{m12}\mathrm{cP9\_m})$ $\mathrm{compartment}(\mathrm{cP9\_m}-\mathrm{m13}\mathrm{cP9})$ $\mathrm{compartment}(\frac{1}{(1+(\mathrm{r8}(\mathrm{cL}+\mathrm{f5}\mathrm{cC}))^2)(1+\left(\frac{\mathrm{r9}(\mathrm{cLUX}+\mathrm{f6}\mathrm{cNOX})(\mathrm{cE34}+\mathrm{f1}\mathrm{cE3})}{1+\mathrm{f3}(\mathrm{cLUX}+\mathrm{f2}\mathrm{cNOX})+\mathrm{f4}(\mathrm{cE34}+\mathrm{f1}\mathrm{cE3})}\right)^2)(1+(\mathrm{r10}\mathrm{cTn})^2)(1+(\mathrm{r41}\mathrm{cP5n})^2)}-\mathrm{m14}\mathrm{cP7\_m})$ $\mathrm{compartment}(\mathrm{cP7\_m}-(\mathrm{m15}+\mathrm{m23}(1-\mathrm{light}))\mathrm{cP7})$ $\mathrm{compartment}(\frac{1+\mathrm{a4}\mathrm{r34}\mathrm{cR}}{(1+\mathrm{r34}\mathrm{cR})(1+(\mathrm{r12}(\mathrm{cL}+\mathrm{f5}\mathrm{cC}))^2)(1+\left(\frac{\mathrm{r13}(\mathrm{cLUX}+\mathrm{f6}\mathrm{cNOX})(\mathrm{cE34}+\mathrm{f1}\mathrm{cE3})}{1+\mathrm{f3}(\mathrm{cLUX}+\mathrm{f2}\mathrm{cNOX})+\mathrm{f4}(\mathrm{cE34}+\mathrm{f1}\mathrm{cE3})}\right)^2)(1+(\mathrm{r14}\mathrm{cTn})^2)}-\mathrm{m16}\mathrm{cP5\_m})$ $\mathrm{compartment}(\mathrm{cP5\_m}-(\mathrm{m17}+\mathrm{m24}\mathrm{cZTL})\mathrm{cP5c}-\mathrm{t5}\mathrm{cP5c}+\mathrm{t6}\mathrm{cP5n})$ $\mathrm{compartment}(\mathrm{t5}\mathrm{cP5c}-\mathrm{t6}\mathrm{cP5n}-\mathrm{m42}\mathrm{cP5n})$ $\mathrm{compartment}(\frac{1+\mathrm{a5}\mathrm{r35}\mathrm{cR}}{(1+\mathrm{r35}\mathrm{cR})(1+(\mathrm{r15}(\mathrm{cL}+\mathrm{f5}\mathrm{cC}))^2)(1+\left(\frac{\mathrm{r16}(\mathrm{cLUX}+\mathrm{f6}\mathrm{cNOX})(\mathrm{cE34}+\mathrm{f1}\mathrm{cE3})}{1+\mathrm{f3}(\mathrm{cLUX}+\mathrm{f2}\mathrm{cNOX})+\mathrm{f4}(\mathrm{cE34}+\mathrm{f1}\mathrm{cE3})}\right)^2)(1+(\mathrm{r17}\mathrm{cTn})^2)}-\mathrm{m5}\mathrm{cT\_m})$ $\mathrm{compartment}(\mathrm{t7}\mathrm{cTc}-\frac{\mathrm{t8}}{1+\mathrm{m37}\mathrm{cP5n}}\mathrm{cTn}-\frac{\mathrm{m43}}{1+\mathrm{m38}\mathrm{cP5n}}\mathrm{cTn})$ $\mathrm{compartment}(\mathrm{cT\_m}-(\mathrm{m8}+\mathrm{m6}\mathrm{cZTL})\mathrm{cTc}-\mathrm{t7}\mathrm{cTc}+\frac{\mathrm{t8}}{1+\mathrm{m37}\mathrm{cP5n}}\mathrm{cTn})$ $\mathrm{compartment}(\frac{1+\mathrm{a6}\mathrm{r36}\mathrm{cR}}{(1+\mathrm{r36}\mathrm{cR})(1+\left(\frac{\mathrm{r18}(\mathrm{cLUX}+\mathrm{f6}\mathrm{cNOX})(\mathrm{cE34}+\mathrm{f1}\mathrm{cE3})}{1+\mathrm{f3}(\mathrm{cLUX}+\mathrm{f2}\mathrm{cNOX})+\mathrm{f4}(\mathrm{cE34}+\mathrm{f1}\mathrm{cE3})}\right)^2)(1+(\mathrm{r19}(\mathrm{cL}+\mathrm{f5}\mathrm{cC}))^2)(1+(\mathrm{r20}\mathrm{cTn})^2)}-\mathrm{m7}\mathrm{cE4\_m})$ $\mathrm{compartment}(\mathrm{p23}\mathrm{cE4\_m}-\mathrm{m35}\mathrm{cE4}-\mathrm{cE4}^2)$ $\mathrm{compartment}(\mathrm{cE4}^2-\mathrm{m36}\mathrm{cE4d}-\mathrm{p25}\mathrm{cE3}\mathrm{cE4d})$ $\mathrm{compartment}(\frac{1}{1+(\mathrm{r21}(\mathrm{cL}+\mathrm{f5}\mathrm{cC}))^2}-\mathrm{m26}\mathrm{cE3\_m})$ $\mathrm{compartment}(\mathrm{p16}\mathrm{cE3\_m}-\mathrm{p25}\mathrm{cE3}\mathrm{cE4d}-(\mathrm{m30}\mathrm{cCOP1d}+\mathrm{m29}\mathrm{cCOP1n}+\mathrm{m9}+\mathrm{m10}\mathrm{cGn})\mathrm{cE3})$ $\mathrm{compartment}(\mathrm{p25}\mathrm{cE3}\mathrm{cE4d}-\mathrm{m22}\mathrm{cE34}(\mathrm{m30}\mathrm{cCOP1d}+\mathrm{m29}\mathrm{cCOP1n}+\mathrm{m9}+\mathrm{m10}\mathrm{cGn}))$ $\mathrm{compartment}(\frac{1+\mathrm{a7}\mathrm{r37}\mathrm{cR}}{(1+\mathrm{r37}\mathrm{cR})(1+\left(\frac{\mathrm{r22}(\mathrm{cLUX}+\mathrm{f6}\mathrm{cNOX})(\mathrm{cE34}+\mathrm{f1}\mathrm{cE3})}{1+\mathrm{f3}(\mathrm{cLUX}+\mathrm{f2}\mathrm{cNOX})+\mathrm{f4}(\mathrm{cE34}+\mathrm{f1}\mathrm{cE3})}\right)^2)(1+(\mathrm{r23}(\mathrm{cL}+\mathrm{f5}\mathrm{cC}))^2)(1+(\mathrm{r24}\mathrm{cTn})^2)}-\mathrm{m34}\mathrm{cLUX\_m})$ $\mathrm{compartment}(\mathrm{cLUX\_m}-\mathrm{m39}\mathrm{cLUX})$ $\mathrm{compartment}(\mathrm{n5}-\mathrm{p6}\mathrm{cCOP1c}-\mathrm{m27}\mathrm{cCOP1c}(1+\mathrm{p15}\mathrm{light}))$ $\mathrm{compartment}(\mathrm{p6}\mathrm{cCOP1c}-(\mathrm{n14}+\mathrm{n6}\mathrm{light}\mathrm{cP})\mathrm{cCOP1n}-\mathrm{m27}\mathrm{cCOP1n}(1+\mathrm{p15}\mathrm{light}))$ $\mathrm{compartment}((\mathrm{n14}+\mathrm{n6}\mathrm{light}\mathrm{cP})\mathrm{cCOP1n}-\mathrm{m31}\mathrm{cCOP1d}(1+\mathrm{m33}(1-\mathrm{light})))$ $\mathrm{compartment}(\mathrm{p14}-\mathrm{p12}\mathrm{cZTL}\mathrm{cGc}-(\mathrm{p13}(1-\mathrm{light})+\mathrm{p10}\mathrm{light})\mathrm{cZG}-\mathrm{m20}\mathrm{cZTL})$ $\mathrm{compartment}(\mathrm{p12}\mathrm{cZTL}\mathrm{cGc}-(\mathrm{p13}(1-\mathrm{light})+\mathrm{p10}\mathrm{light})\mathrm{cZG}-\mathrm{m21}\mathrm{cZG})$ $\mathrm{compartment}(\frac{1+\mathrm{a8}\mathrm{r38}\mathrm{cR}}{(1+\mathrm{r38}\mathrm{cR})(1+\left(\frac{\mathrm{r25}(\mathrm{cLUX}+\mathrm{f6}\mathrm{cNOX})(\mathrm{cE34}+\mathrm{f1}\mathrm{cE3})}{1+\mathrm{f3}(\mathrm{cLUX}+\mathrm{f2}\mathrm{cNOX})+\mathrm{f4}(\mathrm{cE34}+\mathrm{f1}\mathrm{cE3})}\right)^2)(1+(\mathrm{r26}(\mathrm{cL}+\mathrm{f5}\mathrm{cC}))^2)(1+(\mathrm{r27}\mathrm{cTn})^2)}-\mathrm{m18}\mathrm{cG\_m})$ $\mathrm{compartment}(\mathrm{p11}\mathrm{cG\_m}-\mathrm{p12}\mathrm{cZTL}\mathrm{cGc}-(\mathrm{p13}(1-\mathrm{light})+\mathrm{p10}\mathrm{light})\mathrm{cZG}-\mathrm{p28}\mathrm{cGc}+\frac{\mathrm{p29}}{1+\mathrm{t9}(\mathrm{cE3}+\mathrm{cE34})}\mathrm{cGn}-\mathrm{m19}\mathrm{cGc})$ $\mathrm{compartment}(\mathrm{p28}\mathrm{cGc}-\frac{\mathrm{p29}}{1+\mathrm{t9}(\mathrm{cE3}+\mathrm{cE34})}\mathrm{cGn}-\mathrm{m19}\mathrm{cGn}-\mathrm{m25}(\mathrm{cE3}+\mathrm{cE34})(1+\mathrm{m28}\mathrm{cCOP1d}+\mathrm{m32}\mathrm{cCOP1n})\mathrm{cGn})$ $\mathrm{compartment}(\frac{1}{(1+(\mathrm{r28}(\mathrm{cL}+\mathrm{f5}\mathrm{cC}))^2)(1+(\mathrm{r29}\mathrm{cP7})^2)}-\mathrm{m44}\mathrm{cNOX\_m})$ $\mathrm{compartment}(\mathrm{cNOX\_m}-\mathrm{m45}\mathrm{cNOX})$ $\mathrm{compartment}(\frac{1}{1+(\mathrm{r30}\mathrm{cP9})^2+(\mathrm{r31}\mathrm{cP7})^2+(\mathrm{r32}\mathrm{cP5n})^2}-\mathrm{m46}\mathrm{cR\_m})$ $\mathrm{compartment}(\mathrm{cR\_m}-\mathrm{m47}\mathrm{cR})$ $\mathrm{time}\ge \mathrm{turntime}$ $1-\mathrm{light}$ $\mathrm{turntime}+12$