Selected Cell
Cell:
Value:
RNAinVAL_DNA_removal_test
A
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C
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I
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O
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AA
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AD
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AI
AJ
1
2
3
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44
amplikon | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 | 23 | 24 | ||||||||||||
18S | A | larva_leg 100x | larva_leg 1000x | adult_head 100x | adult_head 1000x | adult_legs 100x | adult_legs 1000x | adult_antena 100x | adult_antena 1000x | 10 | 10 | 100 | 100 | 1000 | 1000 | ||||||||||||||||||||
B | 10 000 | 10 000 | 100 000 | 100 000 | NTC | NTC | |||||||||||||||||||||||||||||
LdRP4_SYBR | C | larva_leg 10x | larva_leg 100x | adult_head 10x | adult_head 100x | adult_legs 10x | adult_legs 100x | adult_antena 10x | adult_antena 100x | 10 | 10 | 100 | 100 | 1000 | 1000 | vzorcev/amplikon: | 4 | ||||||||||||||||||
D | 10 000 | 10 000 | 100 000 | 100 000 | NTC | NTC | lukenj/vz: | 4 | |||||||||||||||||||||||||||
mesh | E | larva_leg 10x | larva_leg 100x | adult_head 10x | adult_head 100x | adult_legs 10x | adult_legs 100x | adult_antena 10x | adult_antena 100x | 10 | 10 | 100 | 100 | 1000 | 1000 | NTC, umeritvena: | 12 | ||||||||||||||||||
F | 10 000 | 10 000 | 100 000 | 100 000 | NTC | NTC | procent izgub: | 15 | % | ||||||||||||||||||||||||||
alas | G | larva_leg 10x | larva_leg 100x | adult_head 10x | adult_head 100x | adult_legs 10x | adult_legs 100x | adult_antena 10x | adult_antena 100x | 10 | 10 | 100 | 100 | 1000 | 1000 | št. reakcij z upoštevano izgubo: | 32.2 | ||||||||||||||||||
H | 10 000 | 10 000 | 100 000 | 100 000 | NTC | NTC | |||||||||||||||||||||||||||||
JHBP_TqMn | I | larva_leg 10x | larva_leg 100x | adult_head 10x | adult_head 100x | adult_legs 10x | adult_legs 100x | adult_antena 10x | adult_antena 100x | 10 | 10 | 100 | 100 | 1000 | 1000 | ||||||||||||||||||||
J | 10 000 | 10 000 | 100 000 | 100 000 | NTC | NTC | |||||||||||||||||||||||||||||
JHBP_SYBR | K | larva_leg 10x | larva_leg 100x | adult_head 10x | adult_head 100x | adult_legs 10x | adult_legs 100x | adult_antena 10x | adult_antena 100x | 10 | 10 | 100 | 100 | 1000 | 1000 | ||||||||||||||||||||
L | 10 000 | 10 000 | 100 000 | 100 000 | NTC | NTC | RNAinVAL škatla | ||||||||||||||||||||||||||||
M | TaqMan amplikoni | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
N | št. reakcij: | 33 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
O | sonda: | 150 | 0.075 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
P | FP: | 300 | 0.05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
RP: | 300 | 0.05 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
1) | za vzorce pripraviti 3 redčine | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
MIX for each amplicon | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
2) | pool še enkrat redčit iz 10x ---> 100, 1000, 10 000, 100 000 | UMM (2x) | 82.5 | ul | MasterMix used: | ||||||||||||||||||||||||||||||
FP | 1.6500000000000001 | ul | Roche Probes Master with ROX | ||||||||||||||||||||||||||||||||
RP | 1.6500000000000001 | ul | SYBR Power Abi | ||||||||||||||||||||||||||||||||
sonda | 2.475 | ul | |||||||||||||||||||||||||||||||||
ddH2O | 10.724999999999994 | ul | |||||||||||||||||||||||||||||||||
vzorci | 66 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
skupaj mixa | 99 | ul | |||||||||||||||||||||||||||||||||
pipetiramo | 3 | ul | |||||||||||||||||||||||||||||||||
skupaj Mix+Vz | 165 | ul | |||||||||||||||||||||||||||||||||
ostane mixa | 15 | ul | |||||||||||||||||||||||||||||||||
primerji: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock | Delovne raztopine za 5 ul reakcije: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primerji | priprava | uM | ul v mix | V reakcije | konc/reakcijo | nM | |||||||||||||||||||||||||||||
100 uM | 30 uM | 30+70 | 30 | 0.15 | 5 | 0.9 | 900 | ||||||||||||||||||||||||||||
30 | 0.09999999999999999 | 5 | 0.6 | 599.9999999999999 | |||||||||||||||||||||||||||||||
30 | 0.049999999999999996 | 5 | 0.3 | 299.99999999999994 | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sonda | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
100 uM | 10 uM | 10+90 | 10 | 0.125 | 5 | 0.25 | 250 | ||||||||||||||||||||||||||||
10 | 0.075 | 5 | 0.15 | 150 |